Наибольшее количество случаев оказания помощи по профилю «нейрохирургия» предполагается по 11-й группе ВМП (210 квот), включающей лечение опухолей головного и спинного мозга и заболеваний позвоночника. Кроме того, в центре будут оказывать ВМП по профилю «онкология» (17-я группа ВМП) – 20 квот.
О том, что ФЦЦПИ в 2020 году получит госзадание на оказание ВМП, не включенной в базовую программу ОМС, стало известно в июле 2019 года. В сентябре центру выделили 501 квоту по профилям «нейрохирургия», «неврология» и «нейрореабилитация». Исполняющий обязанности директора медучреждения Всеволод Белоусов на своей странице в Facebook писал, что квоты на постинсультную нейрореабилитацию закончились в ноябре 2019 года.
В 2020 году Центр инсульта также вошел в реестр медорганизаций – участниц программы госгарантий в пяти регионах Центрального федерального округа. ФЦЦПИ упоминается в территориальных программах госгарантий и реестрах фондов ОМС Москвы, Калужской, Тульской, Белгородской и Брянской областей.
Анонсированный в 2005 году бывшим министром здравоохранения Вероникой Скворцовой Федеральный центр цереброваскулярной патологии и инсульта открылся в июле 2019 года. Директором медучреждения стал главный внештатный специалист – невролог Департамента здравоохранения Москвы, профессор РНИМУ им. Н.И. Пирогова Николай Шамалов. Затем и. о. директора центра назначили руководителя лаборатории молекулярных технологий Института биоорганической химии РАН Всеволода Белоусова.
Медучреждение разместилось в Москве на улице Островитянова в комплексе зданий общей площадью 68,9 тысячи кв. м. На этапе строительства предполагалось, что в составе центра будет работать консультативная поликлиника на 250 посещений в смену, стационар на 300 коек, а также лечебно-диагностическое отделение и учебный центр на 740 мест. Также в ФЦЦПИ должны были функционировать отделения анестезиологии и реанимации, нейрохирургии, неврологии, медицинской реабилитации.