По материалам Вологодского городского суда (первая инстанция), 10 февраля 2017 года в приемное отделение стационара ВОДКБ в тяжелом состоянии была доставлена девочка. Во время нахождения пациентки в отделении анестезиологии-реанимации Смирнов оказал ей медпомощь «несвоевременно и не в полном объеме». На следующий день девочка умерла.

Причинно-следственная связь между действиями врача и смертью пациентки была подтверждена датированным 1 декабря 2017 года заключением судебно-медицинских экспертов. Рассматривавший дело Вологодский городской суд назначил Алексею Смирнову наказание в виде двух лет лишения свободы в колонии-поселении и лишил его права заниматься врачебной деятельностью сроком на 2,5 года.

Коллектив ВОДКБ обратился с открытым письмом к общественности, заявив о намерении обжаловать судебное решение. По мнению авторов петиции, суд не учел ни показания приглашенных экспертов, ни результаты повторной экспертизы истории болезни.

Алексей Смирнов и его адвокат обжаловали приговор в Вологодском областном суде. Была назначена комплексная судебно-медицинская экспертиза, которая не установила причинно-следственной связи между действиями Смирнова и смертью пациентки. Областной суд оправдал врача, признав его право на реабилитацию.