Данные о финансировании медцентров содержатся в проектах Минздрава об особенностях оплаты и оказания медпомощи в Донецкой и Луганской народных республиках, Херсонской и Запорожской областях. Предполагается, что около 388 млн рублей выделит федеральный бюджет, а 260 млн рублей уйдут из нормированного страхового запаса ФФОМС. Разделение по источникам финансирования связано с особенностями оплаты медпомощи на новых территориях – пока не все жители этих регионов застрахованы в ОМС.

На оплату медпомощи во II–IV кварталах 2023 года ДГМУ уйдет меньшая часть суммы, или 223,4 млн рублей, ИНВХ на работу во второй половине года – более 450 млн рублей. За весь 2023 год плановое финансирование клиник составляет 1,1 млрд рублей: 460 млн рублей из ФФОМС и 689 млн рублей за счет федерального бюджета. Сумма рассчитана, исходя из нормативов программы госгарантий и информации медцентров, а также исходя из прогнозной доли граждан новых регионов с полисом ОМС.

Оба медцентра в 2023 году перешли в ведение Минздрава РФ. ИНВХ, крупнейший многопрофильный медцентр ДНР, кроме того, попал в список медцентров, имеющих право оказывать в 2024 году ВМП вне базовой программы ОМС.

Особенности оплаты медпомощи в новых российских регионах утверждены правительством в феврале 2023 года. До конца года работает переходный период, в течение которого любая медпомощь в организациях, подведомственных властям новых территорий, оказывается за счет их же бюджетов, а лечение жителей новых субъектов в российских и федеральных клиниках компенсируется как федеральным бюджетом, так и ФФОМС.

Региональные клиники, сообщал Минздрав РФ в марте, получат 2,74 млрд рублей на лечение жителей ДНР, ЛНР, Запорожской и Херсонской областей, а общая потребность в таком виде медпомощи оценивалась ранее ведомством в 6,6 млрд рублей.