Алла Самойлова сменила на посту Давида Мелик-Гусейнова, работавшего в департаменте с апреля 2019 года по февраль 2020 года и назначенного в марте 2020 года вице-губернатором Нижегородской области, где он будет курировать социальный блок регионального правительства.

В 1990 году Алла Самойлова окончила Чувашский государственный университет им. И.Н. Ульянова по специальности «лечебное дело, акушерство и гинекология». С 1994 по 2001 год она работала главврачом чебоксарского медицинского центра «Семья», а затем руководила Республиканским центром планирования семьи и репродукции. В 2001 году Самойлова была назначена главврачом Президентского перинатального центра, в 2012 году – заместителем председателя Кабинета министров Чувашской Республики, а также министром здравоохранения и социального развития региона.

На посту главы республиканского Минздрава Алла Самойлова работала до февраля 2017 года. В июле 2018 года она стала советником руководителя Росздравнадзора, позже – начальником Управления контроля за реализацией государственных программ в сфере здравоохранения.

Департамент проектной деятельности Минздрава РФ был создан в апреле 2019 года для обеспечения контроля реализации нацпроектов и проектов министерства – ранее эти функции исполнял департамент мониторинга, анализа и стратегического развития здравоохранения.