Юрий Ерофеев родился 28 января 1964 года в Омске. В 1987 году окончил санитарно-гигиенический факультет Омского медицинского института по специальности «гигиена, санитария, эпидемиология». Работал в Тюменской области главным врачом районной санэпидстанции.
В 1991 году стал главным врачом Центра санэпиднадзора в Усть-Ишимском районе Омской области, затем с 1996 по 2005 год возглавлял Центр санэпиднадзора Омского района. После этого возглавил ТУ Роспотребнадзора региона.
С 2008 по 2012 год был министром здравоохранения Омской области. Будучи на этом посту, оказался фигурантом уголовного дела о закупках томографов для Омской ОКБ и онкодиспансера. Дело в отношении Юрия Ерофеева по статье «халатность» впоследствии было закрыто за истечением срока давности.
Покинув пост министра, он сначала работал главным научным сотрудником отдела гигиены окружающей среды и здоровья населения ФБУН «Новосибирский НИИ гигиены», а затем главным врачом Большеуковской центральной районной больницы.
Редакция Vademecum выражает соболезнование семье, друзьям и коллегам Юрия Ерофеева.