На этот раз Минздрав не стал продлевать с Байрамгуловым трудовой договор, который истекает 21 ноября. Однако Байрамгулов не согласен и с этим решением и намерен оспаривать его в суде. 

По мнению заместителя председателя бюро по защите прав предпринимателей регионального отделения «Опоры России» Эльвины Лукмановой, на этот раз у Байрамгулова не будет «судебной перспективы», поскольку истечение срока контракта является объективным основанием для прекращения трудовых отношений с работником, пишет «Коммерсантъ».

В январе 2017 года Минздрав Башкирии попытался уволить Байрамгулова в первый раз, однако ему удалось оспорить это решение в Верховном суде республике. Приказ о его увольнении последовал после того, как он выступил  в СМИ с критикой планов объединения перинатального центра с ГБУЗ «Клинический роддом №4».

«Коллектив я собирал два года, все они хорошие специалисты. Если же объединение произойдет, то сокращения будут и у нас, и в роддоме №4. Конечно, направление работы этих двух учреждений сходно. Но все же специфика у каждого своя. К тому же люди сейчас выбирают не столько роддом, сколько конкретного врача. Почему вдруг решили оптимизировать только что открытый центр, мне непонятно», – заявил тогда Байрамгулов.

Кроме того, весной, оставшись без работы, он стал одним из основателей общественной организации «Конгресс башкирского народа», которая в июле и сентябре провела в Уфе два митинга за отставку главы республики Рустэма Хамитова. Сам Байрамгулов не исключает, что непродлению контракта способствовала его общественная деятельность, хотя в Минздраве ему об этом не напоминали.

Республиканский перинатальный центр в Уфе на 130 мест был построен за 1,79 млрд рублей госкорпорацией «Ростех» и открылся в октябре 2016 года. Центр занял 37-е место в рейтинге Vademecum «ТОП50 крупнейших государственных медицинских проектов по объему инвестиций».