В начале декабря 2016 года расходы по программе были увеличены на 18 млн рублей. Так, в предыдущей редакции от 23 декабря 2016 года на реализацию госпрограммы было предусмотрено 25,2 млрд рублей из федерального бюджета, 445,6 млрд рублей из краевого, из местных бюджетов – 21,3 млн рублей, из внебюджетных источников – 316,2 млн рублей.

В последней редакции от 30 января 2017 года произошло сокращение средств, выделяемых из федерального бюджета, на 7,1 млрд рублей (до 18 млрд рублей), из краевого бюджета – на 3,7 млрд рублей (до 441,8 млрд рублей), поступающих от муниципалитетов – на 1 млн рублей (до 20,3 млн рублей).

Постановление уже вступило в силу. 

В январе 2017 года Министерство здравоохранения РФ опубликовало новую редакцию госпрограммы «Развитие здравоохранения». Действующая версия предусматривает общее финансирование программы в размере 15,187 трлн рублей на период с 2017 по 2020 год, из них 6,2 трлн рублей – за счет регионов. Однако в паспорте обновленной программы, в отличие от утвержденной в 2014 году версии, данных о региональном финансировании не содержится.