Как следует из доклада Минздрава, расходы за счет государственных источников финансового обеспечения программы в 2012 году составили 1,718 трлн рублей, что на 7,6% больше, чем в 2011 году. Однако доля финансирования программы в ВВП снизилась с 2,9% в 2011 году до 2,7 % в 2012 году. На федеральный бюджет пришлось 411,4 млрд рублей (23,9% от всех расходов), на консолидированный бюджет субъектов РФ – 580,6 млрд рублей (33,8%), на средства ОМС – 726,4 млрд рублей (24,3%). 

В 2012 году бесплатно получили медицинскую помощь в стационарных условиях 30,1 млн человек (в 2011 году – 30,6 млн человек), медицинскую помощь в дневных стационарах – 7 млн человек (в 2011 году – 6,9 млн человек). Общее число лиц, обслуженных скорой медицинской помощью, составило 47,6 млн (в 2011 году – 47,9 млн), число посещений амбулаторно-поликлинических учреждений (с учетом посещений по дополнительной диспансеризации работающих граждан, детей-сирот и 14-летних подростков) – свыше 1,404 млрд (в 2011 году – более 1,415 млрд). 

В реализации территориальных программ приняли участие 10,8 тысяч медицинских организаций различных видов и уровней подчиненности (в 2011 году – 11 тысяч). Больничные учреждения составили 42,7% общего числа медицинских организаций, амбулаторно-поликлинические учреждения – 28,2%, диспансеры – 7,8%, учреждения особого типа и прочие – 5,7%, учреждения охраны материнства и детства и центры – по 4,5%, учреждения скорой медицинской помощи и переливания крови – 3,2% и санаторно-курортные учреждения – 3,4%.