В 2013 году Мураховский защитил диссертацию на тему «Социально-гигиеническая оценка востребованности медицинских технологий при амбулаторно-поликлинической и стационарной помощи взрослому населению (на примере территориальной поликлиники №2 и больницы)».

В этой работе 202 страницы, а заимствования найдены на 13 страницах, что составляет около 7,5% от всего труда.

«Диссернет» обратил внимание, что некоторые фрагменты были полностью скопированы из диссертации Елены Тоцкой, написанной 12 лет назад. Сообщается, что экс-главврач заимствовал цитаты с 20-й по 33-ю страницу.

В августе 2020 года Александр Мураховский в качестве главы омской Больницы скорой медицинской помощи №1 комментировал состояние Алексея Навального. Он утверждал , что в организме политика нет следов ядов, а кома вызвана нарушением обмена веществ. Мураховский препятствовал перевозке оппозиционера на лечение в Берлин, уверяя, что тот находится в «нетранспортабельном состоянии», хотя немецкие специалисты пришли к противоположному выводу.

В клинику Charité в Берлине пациент был доставлен 22 августа 2020 года по просьбе членов его семьи. Анализы позволили диагностировать тяжелое отравление ингибитором холинэстеразы.

В начале ноября Мураховский стал главой областного Министерства здравоохранения.