Над исследованием работали сотрудники Центра наук о жизни «Сколтеха», Высшей школы экономики, НИИ гриппа им. А. А. Смородинцева и Института проблем передачи информации им. А. А. Харкевича.
Ученые изучили 211 образцов вируса, отобранных у пациентов на территории России с 11 марта, когда официально в стране было всего 28 случаев, по 23 апреля 2020 года, когда число заболевших возросло до 62 773. При этом 133 образца были взяты в Санкт-Петербурге, по одному в Ленинградской области и Бурятии. Кроме того, в выборку были включены 76 геномов, доступных на GISAID по состоянию на 26 мая 2020 года. Всего в панели исследования были представлены последовательности генома из образцов, взятых в 25 регионах РФ.
Проанализировав последовательность генома, авторы пришли к выводу, что вирус в Россию был завезен не из Китая. Всего исследователи насчитали как минимум 67 независимых завозов вируса в разные города России в период с конца февраля по начало марта 2020 года, в основном – из европейских стран.
По данным ученых, некоторые случаи завоза вируса не вызвали вспышек инфекции в России. Тем не менее в стране циркулирует не менее девяти различных вариантов вируса, которые не фиксируются в других странах.
«Отдельное внимание ученые уделили вспышке инфекции в одной из больниц Санкт-Петербурга – НМИЦ имени Вредена, где заболело более 400 человек. Было установлено, что из больницы вирус распространился по городу, оказав некоторое влияние на эпидемиологическую ситуацию в Санкт-Петербурге», – сообщили в «Сколтехе». Как отмечается в препринте исследования, высокая доля последовательностей геномов в биоматериалах, взятых в Санкт-Петербурге, родственна образцам коронавируса из клиники. Это указывает на то, что вспышка в НМИЦ Вредена предположительно внесла «существенную долю» в число случаев COVID-19 в городе, напрямую не связанных с лечением или работой в медучреждении, считают авторы.
НМИЦ травматологии и ортопедии им. Вредена в Петербурге с 8 апреля 2020 года был закрыт на карантин из-за вспышки коронавируса. Всего на тот момент в медучреждении находилось более 800 сотрудников и пациентов. Локдаун с клиники был был снят 2 мая.
По состоянию на 20 июля 2020 года в России зафиксировано 777 486 случаев коронавируса, 553 602 человека выздоровели, еще 12 427 пациентов скончались. В Санкт-Петербурге – 29 541 случая, вылечились – 22 425 пациентов, умерли – 1 807 человек.
