В конце 2016 года парламент Челябинской области и губернатор региона Борис Дубровский выделили Минздраву дополнительно 471 млн рублей в связи с сокращением дефицита средств в областном бюджете.

«Министерство эти средства использовало на покупку лекарственных препаратов, которые применяются для лечения заболеваний, входящих в систему ОМС. Таким образом, эти деньги были потрачены неэффективно, потому что не положено выделять бюджетные деньги на те виды заболеваний, которые работают в системе ОМС. Мы просто так потратили полмиллиарда», – заявил Комяков.

По мнению Комякова, такая ситуация не возникла, если бы деньги были переданы не Минздраву, а территориальному фонду ОМС. Последний должен был утвердить «перечень конкретных медучреждений и заболеваний», на которые следовало потратить выделенные средства. 

В неэффективном расходовании средств обвиняют и Министерство здравоохранения России: аудиторы Счетной палаты обнаружили, что при всех затратах плановые показатели снижения смертности населения так и не были достигнуты.