Арбитражный суд Санкт-Петербурга и Ленинградской области решил взыскать с ЗАО «Фармакор» в пользу ПАО «Ленэнерго» 891,5 тысячи рублей неосновательного обогащения и 48,22 тысячи рублей процентов за пользование чужими денежными средствами. Суд опирался на данные проверки, выявившей «факт потребления электрической энергии в период с 10.09.2012 г. по 05.06.2013 г., в отсутствие заключенного в установленном порядке договора энергоснабжения» в помещении на ул. Всеволода Вишневского в Санкт-Петербурге, которое принадлежит аптечной сети. Ответчик утверждал, что в задолженности виноваты субарендаторы помещения, но не смог доказать это документально. Более того, суд счел, что «сокрытие ответчиком факта наличия субарендаторов на момент проведения проверок противоречит принципу добросовестности».

В июле 2015 года тот же суд рассмотрел иск к «Фармакору» со стороны непубличного акционерного общества «Торгово-промышленное предприятие «Северо-Запад», которое с октября 2014 по февраль 2015 года отгрузило аптечной сети партию лекарственных средств, но получатель так и не расплатился за них. Арбитраж решил взыскать с «Фармакора» 15 млн 960 тысяч рублей в счет уплаты за товар 1,3 млн рублей пени. Кроме того, сейчас в арбитраже рассматривается иск «Протека» к «Фармакору» на 65 млн рублей.

Аптечная сеть «Фармакор» находится на 18-й строчке рейтинга журнала Vademecum ТОП200 аптечных сетей за первое полугодие 2015 года с выручкой 2,8 млрд рублей. В управлении сети находится 266 аптек.