В структуру неонатальной клиники будут входить отделение патологии новорожденных, отделение для детей с неврологической патологией, койки интенсивной терапии и реанимации и реанимационно-консультативный центр с выездной бригадой. В больнице будет организован амбулаторно-консультативный прием.

В настоящее время ГУПП «Институт Саратовгражданпроект» ведет работы по проектированию больницы. Детскую больницу разместят рядом с ГКБ№ 12, имеющей развитую инфраструктуру дополнительных служб (пищеблок, ЦСО, гараж). Для этого ГКБ№12 передали здание, где разместят неонатальрую клинику. Это слияние медицинских учреждений позволит властям избежать затрат на создание и обслуживание дополнительных служб, сократить административно-управленческий персонал в новой детской больнице. Cэкономленные средства фонда оплаты труда администрация Саратова планирует направить на повышение заработной платы медицинских работников.

Для размещения медицинского учреждения необходимо провести реконструкцию здания. Предполагаемые затраты на реконструкцию здания составят 51 млн рублей, на оснащение оборудованием направят 100 млн рублей.