Мероприятия программы в Пензенской области за 2011–2013 год обошлись более чем в 5,6 млрд рублей. Ивановская область в ходе программы модернизации освоила 3,9 млрд рублей. В Чувашии на модернизацию здравоохранения направлено 4,8 млрд рублей. Объем денежных средств, предусмотренных на программу в Тюменской области, составил 6,7 млрд рублей. Алтайский край освоил 4,3 млрд рублей за время реализации программы. Инвестиции в модернизацию Горного Алтая составили более 1,4 млрд рублей.
В целом по России программа модернизация выполнена на 93,4%.