Сметная стоимость проектирования и строительства института детской эндокринологии, осуществляемая за счет федеральных ассигнований, составит 6, 557 млрд руб. В 2013 г. на эти цели будет направлено 804,5 млн руб. В 2014 году – 200 млн, в 2015 – 1,7 млрд руб.
Общая стоимость проекта учитывает 3,78 млрд руб., инвестированных в 2007-2012 гг. в строительство и проектные и изыскательские работы.
По информации, размещенной на официальном сайте Эндокринологического научного центра, в медучреждении с 2009 г. идет комплексная реконструкция. Новый корпус института детской эндокринологии будет рассчитан на 200 коек, здесь появятся клиника, поликлиника, сервисные службы, конгресс-центр с интернет-библиотекой, зал телемедицины на 50 мест, пансионат малой вместимости, отделение реабилитации и архив.