Оба нацпроекта к указанному периоду оказались лидерами по исполнению бюджетов. На третьем месте оказался национальный проект «Наука и университеты» (86,6%, или 74,6 млрд рублей из 86,1 млрд).
Из входящих в нацпроект «Здравоохранение» федеральных проектов на 100% к 1 декабря были исполнены «Обеспечение медицинских организаций системы здравоохранения квалифицированными кадрами» (почти 3,3 млрд рублей), «Развитие сети национальных медицинских исследовательских центров и внедрение инновационных медицинских технологий» (11,3 млрд рублей) и «Развитие экспорта медицинских услуг» (27 млн рублей). На четвертом месте оказался федпроект «Борьба с онкологическими заболеваниями» (92,9%, или 170,6 млрд рублей из 183,6 млрд).
Далее следуют федпроекты «Развитие системы оказания первичной медико-санитарной помощи», его бюджет исполнен на 84,8% (6,9 млрд рублей из 8,1 млрд), «Борьба с сердечно-сосудистыми заболеваниями» (71,3%, или 14,2 млрд рублей из 19,9 млрд) и «Создание единого цифрового контура в здравоохранении на основе ЕГИСЗ» (53,7%, или 8,9 млрд рублей из 16,6 млрд). Наименее исполненным (53,3%, или 6,5 млрд рублей из 12,3 млрд) оказался бюджет федпроекта «Развитие детского здравоохранения, включая создание современной инфраструктуры оказания медицинской помощи детям».
Частично относящиеся к сфере здравоохранения и входящие в нацпроект «Демография» федпроекты «Старшее поколение» и «Укрепление общественного здоровья» исполнены соответственно на 87,2% (5,6 млрд рублей из 4,4 млрд) и 98,9% (312,7 млн рублей из 313,6 млн).
По данным Счетной палаты РФ, кассовое исполнение бюджета нацпроекта «Здравоохранение» в 2020 году составило 96,1% (295,7 млрд рублей из 307,36 млрд). Тогда из восьми федпроектов на 100% был исполнен только проект «Развитие экспорта медицинских услуг» (30 млн рублей, причем он реализовывался только 71 регионом). Наименьший процент достижения планового показателя также был у федпроекта «Развитие детского здравоохранения, включая создание современной инфраструктуры оказания медицинской помощи детям» – 84% (34,9 млрд рублей).
