Кроме того, при изменении персональных данных предложено учитывать информацию, предоставленную военными комиссарами.

Ряд корректировок направлен на предоставление возможности использовать ГИС ОМС. Например, в случае утверждения документа региональные клиники будут через эту систему предоставлять в ТФОМС сведения об оказанной медпомощи. Если в субъекте введена в эксплуатацию местная информсистема, то данные могут передаваться через нее, с последующей загрузкой в государственную.

Согласно проекту правил, страховая медорганизация при принятии информации об изменении сведений о застрахованном лице будет вносить данные в единый регистр без их направления в терфонд для уточнения.

Развитие ГИС ОМС в 2022 году получило критику Счетной палаты. Аудиторы выявили, что ряд подсистем государственной информационной системы работают с перебоями, а контракты на модернизацию системы не решают поставленные перед фондом задачи: они исполняются либо с отставанием, либо с нарушениями. Всего на развертывание системы в 2022 году ушло более 2 млрд рублей, из которых 1,14 млрд получили дочерние компании ПАО «Ростелеком» (единственного подрядчика ГИС с 2023 года).

В 2024 году Федеральному фонду ОМС на модернизацию госинформистемы и интеграцию ее с ЕГИСЗ было выделено 6,41 млрд рублей. Сумма в два раза превысила ранее запланированные на год расходы в 3,2 млрд рублей, а также тематические плановые траты на 2023 год (3,3 млрд рублей).

В ноябре 2025 года Минздрав внедрил ГИС для предоставления субсидий на оказание ВМП-II.