В распоряжении указано, что увеличение стоимости контракта до 14,2 млрд рублей возможно по согласованию сторон. Заказчиком является «Единый заказчик в сфере строительства», генподрядчиком – ООО «Тулаоборонстрой». По данным ЕИС в сфере закупок, контракт на 2,25 млрд рублей на завершение реконструкции корпуса «В» заключен в июле 2021 года. Работы должны быть завершены не позднее 31 декабря 2024 года.

Масштабная реконструкция РНЦХ началась еще в 2009 году. Для проведения работ пришлось сократить коечный фонд и переместить все отделения в кардиологический корпус и частично – в корпус гипербарической оксигенации. Тогда же сократили и операционную активность по торакальной хирургии, хирургии пищевода, желудка, трансплантации, хирургии желчных путей, реконструктивной хирургии. В результате снизились объемы квот и финансирование центра. Несмотря на это, срок сдачи корпуса в эксплуатацию все равно неоднократно переносился

На завершение реконструкции в ноябре 2018 года правительство распорядилось направить 5,4 млрд рублей. Отмечалось, что реконструкцию должны закончить к концу 2020 года. В феврале 2021 года на завершающий этап из бюджета направили еще 5,9 млрд рублей, в сентябре этого же года – 1,9 млрд рублей.

В начале апреля 2022 года в состав РНЦХ вошли пять федеральных учреждений, среди них – Центральная клиническая больница РАН, Больница РАН в Троицке (Московская область), Санаторий им. А.М. Горького РАН в Кисловодске (Ставропольский край), Пансионат им. А.И. Майстренко (Краснодарский край) и НИИ морфологии человека им. академика А.П. Авцына. На базе медучреждений создан научно-клинический кластер, а все учреждения работают как одно юридическое лицо.

В августе 2023 года «Единому заказчику в сфере строительства» направили еще 3,1 млрд рублей на завершение реконструкции корпуса «В». Правительство тогда же поручило обеспечить в 2023 году уровень строительной готовности объекта не менее 45%.