Сумма трансферта, который получит Московский городской фонд через Минздрав РФ и московское правительство, не уточняется.
На фоне пандемии коронавируса в 2020 году в регионах кратно увеличились расходы на медпомощь, и часть из них правительство покрывает из своего резервного фонда. Так, в августе 2020 года правительство предоставляло дополнительно 47,5 млрд рублей на компенсацию расходов медучреждений в период с марта по июнь (из них больше всего, 14,2 млрд рублей, было выделено Москве), а всего, говорила вице-премьер РФ Татьяна Голикова, на ноябрь из федбюджета на борьбу с COVID-19 было выделено 510 млрд рублей.
Росли и собственные расходы регионов. Московская мэрия в 2020 году потратила на здравоохранение 863,8 млрд рублей, а финансирование государственной программы «Столичное здравоохранение» увеличилось, по сравнению с 2019 годом, в 1,8 раза, составив 570,3 млрд рублей. Более 10% расходов столичного бюджета было направлено на борьбу с COVID-19 и его последствиями. МГФОМС также вынужден был нарастить тематические расходы, только в январе – мае 2020-го они увеличились на 17,6 млрд рублей относительного того же периода 2019 года и составили 91,7 млрд рублей.
ТФОМС других регионов, зачастую и до того дефицитные, столкнулись с коллапсом. Например, с просьбой выделить дополнительные средства к ФФОМС и Правительству РФ обращались депутаты Республики Карелии и Мурманской области, где совокупно из-за эпидемии COVID-19 медорганизации недополучили более 1,1 млрд рублей.
В январе 2021 года медорганизации, реализующие терпрограмму Московской области, пожаловались на задержку в оплате счетов за медпомощь, оказанную в декабре 2020 года. По данным Vademecum, на это повлияла и задержка с оплатой межтерриториальных расчетов со стороны МГФОМС. В областном ТФОМС тогда ответили, что так получилось из-за необходимости госпитализации пациентов с COVID-19. Задолженность планировалось погасить поэтапно к 15 февраля.
