По версии следствия, с мая 2006 года по декабрь 2012 года Сысойкин в общей сложности растратил 144 млн 800 тысяч рублей. В частности, в 2012 году Приморская краевая аптека выиграла аукцион по закупке лекарств для льготников региона, однако половина выделенных на это денег, пояснили в правоохранительных органах, была выведена на счета Сысойкина. На вторую часть средств аптека закупила лекарства, не соответствующие списку из госзаказа, в результате чего многие льготники остались без лекарств, считает следствие. Чтобы исправить эту ситуацию, пришлось выделить дополнительные средства из краевого бюджета. 

Уголовное дело в отношении экс-главы  КГУП «Приморская краевая аптека» Василия Сысойкина было передано в суд 31 мая 2016 года. На судебном заседании, которое состоялось в понедельник, 4 июля, Сысойкин отказался признать себя виновным и потребовал оправдательного приговора. В случае если вина подозреваемого будет полностью доказана, ему грозит лишение свободы на срок до 10 лет.

Уголовные дела по ряду статей УК РФ в отношении Сысойкина были возбуждены еще в 2013 году, он скрылся от правоохранительных органов, но вскоре был задержан в Черногории и передан российским властям.