Новое дело следователи возбудили по материалам УФСБ России по Красноярскому краю. Предполагается, что с 2019 по 2023 год Баранкин получил от представителя структуры 4 млн рублей, а также имущественные услуги – приобретение строительных материалов и проведение ремонта в доме своей дочери на сумму около 5 млн рублей. Взамен, как полагает следствие, он содействовал заключению контрактов на поставку медоборудования и изделий для нужд центра с определенными компаниями и обеспечивал их беспрепятственное исполнение. Всего, по данным СК, между учреждением и коммерческими организациями было заключено более 30 контрактов.

Бывший гендиректор находится под стражей. В отношении представителя коммерческой компании решается вопрос об избрании меры пресечения. Дело еще расследуется.

Разбирательство в отношении экс-главы ФСНКЦ началось в марте 2023 года: тогда Бориса Баранкина уволили с поста директора после возбуждения уголовного дела в отношении сотрудников центра, обвиняемых в получении в 2019–2022 годах взяток от поставщика медизделий на общую сумму 3,8 млн рублей в виде различных товаров в обмен на предоставление последнему конкурентных преимуществ.

В мае того же года Баранкина отправили под домашний арест – по делу о хищении (ч. 4 ст. 160 УК РФ). В марте 2024 года расследование было завершено, а материалы позднее передали в суд.

В январе 2025 года в отношении Баранкина и представителя некой компании было возбуждено еще одно уголовное дело. Следователи утверждали, что в 2017 году Баранкин якобы обратился к своему знакомому, директору неназванной компании, с предложением о передаче ему взяток за «содействие в организации систематического заключения контрактов» и побед в конкурсах на поставку медизделий.

В начале сентября 2025 года по делу о растрате гособвинитель запросил для Баранкина 7 лет колонии общего режима и штраф в размере 800 тысяч рублей. Фигурантом дела также выступил представитель поставщика препаратов, для которого прокурор запросил 4 года лишения свободы условно.