По данным картотеки арбитражного суда, МИАЦ апеллировал к тому, что отчетные документы и акт сдачи-приемки оказания услуг были оформлены поставщиком неправильно. Также одной из причин неисполнения обязательств по контракту стал тот факт, что НЦИ должен был исполнить контракт до конца декабря 2020 года, но работы затянулись до весны 2021-го. В этот период компания дорабатывала информационную систему.

НЦИ указал, что перепиской между ним и заказчиком подтверждается добросовестность и совершение всех возможных действий для закрытия контракта, а отказ МИАЦ от оплаты является нарушением обязательств.

Крымский МИАЦ в апреле 2022 года пытался включить НЦИ в реестр недобросовестных поставщиков. Однако комиссия Крымского УФАС России не нашла признаков уклонения от исполнения контракта и недобросовестного поведения НЦИ. Кроме того, МИАЦ пытался выйти из сделки в одностороннем порядке.

По данным СПАРК-Интерфакс, ООО «Национальный центр информатизации» было зарегистрировано в городе Иннополисе Республики Татарстан в 2014 году. Бенефициаром юрлица выступает АО «Объединенная приборостроительная корпорация», входящее в структуру госкорпорации «Ростех». В 2022 году НЦИ выручил 2,4 млрд рублей при убытке 5,4 млрд.

НЦИ в октябре 2020 года вошел в совместное предприятие с телемедицинским сервисом «Доктис» Марка Курцера, «Цифромедом» и РФПИ для развития телемедицинской платформы. На компанию возложена функция экспертной и методологической поддержки для соответствия стандартам государственных систем и сервисов в области здравоохранения.