В 1993 году Юрий Нечепоренко окончил Санкт-Петербургский государственный университет по специальности «прикладная математика», имеет ученую степень «магистр математики». С 1993 года работал на разных должностях в Министерстве финансов Саратовской области, с 2005 по 2008 год – в сфере информационных технологий.

В декабре 2008 года Нечепоренко стал начальником Управления информационно-аналитических технологий ФФОМС. Занимал эту должность до февраля 2012 года, затем был назначен заместителем председателя фонда.

Нечепоренко задекларировал в 2019 году доход в 2,6 млн рублей – это меньше, чем у остальных заместителей председателя фонда. У самой главы ФФОМС Елены Черняковой годовой доход, согласно отчету фонда, составил 8,3 млн рублей. В 2019 году Чернякова была директором Департамента информационных технологий в сфере управления государственными и муниципальными финансами и информационного обеспечения бюджетного процесса Минфина РФ.

Сейчас в ФФОМС, согласно официальному сайту ведомства, остается пять заместителей Елены Черняковой – Светлана Кравчук, Александр Кувалдин, Ирина Соколова, Елена Сучкова и Ольга Митрофанова.

В последний раз состав заместителей менялся при назначении Елены Черняковой на должность главы ФФОМС в марте 2020 года – тогда заместителем Черняковой стала ее бывшая коллега из Минфина Ольга Митрофанова.