Повод для проверки изначально был иной: сотрудники медцентра пожаловались, что подписывают документы о получении мотивирующих выплат, но сами средства до них не доходят.
В результате выяснилось, что в разные периоды времени бюджетные средства в размере 18,4 млн рублей, выделявшиеся ТФОМС на долечивание онкобольных после химиотерапии, направлялись на размещение пациентов областного Онкологического центра (входит в «Медицинский город») в гостинице «Море». Отель не располагал необходимыми для долечивания пациентов условиями, и в ведомстве такое расходование средств посчитали нецелевым. В августе 2019 года ТФОМС обратился в Арбитражный суд Тюменской области с иском о взыскании 18,4 млн рублей с «Медицинского города».
В июле 2020 года иск был удовлетворен – Арбитражный суд Тюмени обязал «Медицинский город» выплатить ведомству деньги, потраченные не по назначению.
Между тем областная прокуратура организовала в медцентре собственную проверку и обнаружила, что в 2017-2018 годах главный бухгалтер и главный экономист финансово-экономической службы медицинского учреждения, действуя вместе с другими лицами, необоснованно ежемесячно начисляли подчиненным доплаты. Впоследствии денежные средства передавались главному бухгалтеру и главному экономисту, которые распоряжались ими по своему усмотрению. Таким образом было похищено более 29 млн рублей. По данному факту также возбуждено уголовное дело по ч. 4 ст. 159 УК РФ (мошенничество в особо крупном размере), однако расследование приостановлено в связи с «отсутствием реальной возможности участия обвиняемой в уголовном деле».
Андрей Кудряков возглавлял «Медицинский город» с 2013 по 2019 год. В октябре 2019 года его сменила Елена Неверова, ранее занимавшая должность заместителя главврача. В настоящее время Кудряков является председателем Тюменского регионального медицинского общества.