Супруги проходят подозреваемыми в соучастии по делу о растрате 1,3 млрд рублей из бюджета НМИЦ. Они были задержаны 3 июня 2019 года, дело возбуждено по ч. 4 ст. 159 УК РФ (мошенничество, совершенное организованной группой либо в особо крупном размере) и ст. 174.1 УК РФ (легализация преступных доходов).

По решению Центрального районного суда Новосибирска 5 июня 2019 года Бойцову поместили в СИЗО, Караськова заключили под стражу 11 июня. Адвокаты подозреваемых обжаловали решение в Новосибирском областном суде, однако жалобы были отклонены. В начале августа суд продлил обоим фигурантам срок содержания в СИЗО до 19 ноября 2019 года, а затем изменил им меру пресечения на домашний арест на тот же срок.

В деле помимо супругов фигурируют топ-менеджеры ГК «Клатона» Александр Сорокин, Евгений Первушин и Александр Третьяков, а также заместитель Караськова Евгений Покушалов, до 19 ноября находящийся под домашним арестом.

Параллельно ГК «Клатона» не удалось оспорить решение УФАС Новосибирской области об участии в картельном сговоре на 187 аукционах на общую сумму 6 млрд рублей. Группа пыталась отстоять свои интересы сначала в региональном арбитраже, а затем в Седьмом арбитражном апелляционном суде, который ответил отказом.