Стройка объекта с коечным фондом на 350 мест остановилась из-за нехватки финансирования. В 2017 году предпринималась попытка возобновить работы на площадке. Тогда региональные власти запрашивали на завершение проекта 3 млрд рублей из федерального бюджета, а Минздрав РФ предложил умерить запрос, сократив мощность будущего объекта.

В апреле 2019 года Минстрой Новосибирской области объявил аукцион по отбору подрядчика на реконструкцию и оснащение акушерского корпуса областной больницы. Максимальная цена контракта составила 499 млн рублей. Подряд достался АО «Бердский строительный трест», которое является регулярным исполнителем региональных подрядов. По данным СПАРК-Интерфакс, в 2019 году сумма контрактов компании составила более 1 млрд рублей.

После этого губернатор Новосибирской области Андрей Травников заявил о возобновлении строительства перинатального центра, добавив, что его планируется сдать в эксплуатацию в 2021 году.  Заместитель губернатора Новосибирской области Сергей Нелюбов сообщил, что, по условиям контракта, к концу 2019 года готовность объекта достигнет 22%. Пока центр готов на 16%.

Перинатальный центр расположится на территории Новосибирской областной клинической больницы. По словам Нелюбова, это позволит организовать в регионе полноценную «трехуровневую систему помощи женщинам и детям».