В проекте программы госгарантий протонная терапия входит во второй перечень медицинской помощи, не погруженной в ОМС. Она показана при злокачественных новообразованиях головы и шеи, трахеи, бронхов, легкого, плевры, средостения, щитовидной железы, молочной железы, желудочно-кишечного тракта, мочеполовой системы, предстательной железы, костей и суставных хрящей, кожи, мягких тканей и почек.

Предложенный средний финансовый норматив был обозначен ранее, так как на лечение 2 тысяч случаев планировалось выделить порядка 5 млрд рублей. При этом Радиологический центр ФМБА получил в 2019 году на клиническую апробацию метода значительно больше в расчете на один случай – на лечение ста человек направили 470 млн рублей. Пока центр не начал принимать пациентов.

В настоящее время в России работает только протонный центр Медицинского института им. Сергея Березина (МИБС) в Санкт-Петербурге. Курс лечения здесь оценивается в 1,8 млн рублей. В центр на лечение направляются пациенты из Москвы, Мурманской области и других регионов.

В июне 2019 года на ПМЭФ создание центра протонной терапии анонсировала госкорпорация ВЭБ.РФ. Вместе с МИБС она инвестирует 7,5 млрд рублей в строительство медучреждения в одном из регионов Центрального федерального округа.

Еще один крупный проект – строительство госкорпорацией «Ростех» центра протонной терапии в Калужской области на базе НМИЦ радиологии с участием чешской компании Proton Therapy Development s.r.o и объемом инвестиций 12 млрд рублей. Кроме того, протонные центры «Ростеха» появятся в МГУ им. М.В. Ломоносова в Москве, на базе Новосибирского государственного университета, в Приморье и Обнинске.