Янина в декабре 2024 года задержали сотрудники правоохранительных органов, тогда же суд заключил его под стражу. Примерно в это же время чиновник покинул свою должность. В сентябре 2025 года Октябрьский райсуд Владимира постановил изменить меру пресечения Янину с содержания в СИЗО на домашний арест – до 10 ноября 2025 года.

Как полагают следователи, с 2021 года Валерий Янин, являясь главврачом Александровской районной больницы, создал схему с необоснованными выплатами подчиненным. По версии СК, часть из этих денег возвращалась Янину.

В материалах дела указано, что после назначения министром здравоохранения Владимирской области в ноябре 2023 года фигурант якобы продолжил противоправную деятельность. Общий ущерб правоохранители оценили в более 400 тысяч рублей. Изначально Янину вменяли еще и ч. 3 ст. 160 УК РФ (присвоение в крупном размере с использованием служебного положения). На данный момент информацию о расследовании этого эпизода в суде не предоставили.

С июля 2025 года и. о. министра здравоохранения Владимирской области является Тамара Томаева, ранее занимавшая пост первого замглавы ведомства. Томаева стала третьим руководителем регионального Минздрава после отставки Янина.