На премирование могут претендовать специалисты подведомственных учреждений ФМБА (29,4 млн рублей, из них 6,8 млн рублей – на оплату труда) и федеральные госслужащие территориальных органов агентства (14,1 млн рублей, в том числе почти 3,3 млн рублей – на оплату труда).

Кроме того, на те же цели правительство направило более 14 млн рублей Управлению делами Президента РФ. На оплату труда работников ведомства пойдет 3,2 млн рублей. Согласно распоряжению правительства, ФМБА и Управделами президента должны проконтролировать целевое и эффективное использование средств и предоставить по результатам доклад до 1 февраля 2023 года.

Правительство начало направлять специалистам ФМБА стимулирующие выплаты в апреле 2020 года. На поощрение работников,  оказывавшим медпомощь пациентам с COVID-19, было направлено более 751 млн рублей. В августе 2020 года премьер-министр РФ Михаил Мишустин сообщил, что на стимулирующие выплаты сотрудникам центров ФМБА будут выделены дополнительные 320 млн рублей.

Федеральные стимулирующие, а с конца 2020 года – специальные социальные выплаты за помощь пациентам с COVID-19 также получают медики различных учреждений здравоохранения. Так, в декабре 2021 года из резервного фонда правительства на осуществление спецвыплат было направлено 51,6 млрд рублей.