Начальная максимальная цена контракта составила 1,499 млрд рублей, строительство должно завершиться к 2024 году. В январе 2021 года победителем стала региональная строительная компания ПСК, помимо нее в конкурсе участвовали Строительное управление №1, трест «Башгражданстрой» и «Дортрансстрой» – все они также зарегистрированы в Уфе.

СУ №1 не согласилось с результатами тендера и обжаловало решение в ФАС, сославшись на то, что при подведении итогов заказчик учел работы на 436 млн рублей вместо заявленных 5 млрд, получив недостаточное количество баллов для победы по нестоимостному критерию конкурса. В начале февраля 2021 года ФАС аннулировала результаты тендера.

Таким образом, после переоценки СУ №1 получило 97,26 балла и стало победителем тендера, «Дортрансстрой» – 80 баллов, а ПСК – 72,6 балла и занял третье место.

Предполагается, что в новом корпусе РДКБ площадью 17,8 тысячи кв. м разместятся приемное отделение, включающее кабинеты детского онколога, гематолога и иммунолога, дневной стационар на 10 коек, блок иммунологии на 10 коек, отделения онкологии и гематологии, рассчитанные на 31 койку, блок реанимации и интенсивной терапии и трансплантации костного мозга на семь и шесть коек соответственно.

Кроме того, в центре разместятся операционные, криохранилище со службой трансфузиологии, иммунологическая, молекулярно-генетическая, цитогенетическая и гистологическая лаборатории.

В мае 2020 года строительство объекта по нацпроекту «Здравоохранение» одобрил глава Минздрава РФ Михаил Мурашко.