Шуршуков взял на себя руководство областным здравоохранения после того, как отстранили Алексея Байцурова, который пробыл на своей должности менее года (2015–2016 годы). Официальная причина увольнения так и не была озвучена, но местные СМИ предполагали, что причиной отставки мог послужить всплеск детской смертности.
Юрий Шуршуков окончил Воронежский государственный медицинский институт им. Н.Н. Бурденко, в 2009 году завершил обучение в Орловской региональной академии госслужбы по специальности «государственное и муниципальное управление».
Свою карьеру глава Управления здравоохранения начал в 1985 году санитаром в военной части, после работал ассистентом кафедры акушерства и гинекологии института им. Н.Н. Бурденко. С 1997 года занимал должность врача акушера-гинеколога Липецкой центральной районной больницы, в 1999–2002 годах – заведующего отделением, врачом акушером-гинекологом Липецкой областной клинической больницы.
С 2002 года работает в Управлении здравоохранения Липецкой области, с июля 2016 года до настоящего назначения – в качестве первого заместителя начальника управления.