Гособвинение считало Кошурникова виновным в превышении должностных полномочий (ст. 286 УК) при выделении земельного участка и выдаче разрешения на строительство для «НТфармы» и просило два года лишения свободы с запретом занимать руководящие должности в течение трех лет.
Кошурников был задержан в ноябре 2016 года по делу о растрате 1 млрд рублей, которые госкорпорация «Роснано» выделила компании «НТфарма» на строительство фармзавода в Ярославской области. Завод должны были запустить к сентябрю 2012 года, но срок неоднократно переносился, а деньги исчезли.
Помимо Кошурникова, по делу были арестованы учредитель «НТфармы» Рустам Атауллаханов и гендиректр Евгений Султанов. В апреле 2017 года Султанов свою вину признал и был заключен под домашний арест. Атауллаханов находится под стражей, он обвиняется в растрате и отмывании денег. Султанов находится под домашним арестом, ему предъявлено обвинение в растрате.