Следователи СК РФ по РК задержали Попова 30 июня 2017 года. В отношении него было возбуждено уголовное дело по ч. 3 и п. «в» ч. 5 ст. 290 УК РФ «Получение взятки». Теперь суд признал его виновным и назначил наказание в виде пяти лет лишения свободы в колонии строгого режима. Также на протяжении восьми лет Андрей Попов не сможет занимать руководящие должности в госорганах. Сумму полученной взятки в размере 1,2 млн рублей суд конфисковал. Приговор еще не вступил в законную силу.
За Попова вступилось местное сообщество врачей. Они написали обращение на имя Президента России Владимира Путина с просьбой изменить меру пресечения на домашний арест. В начале марта 2018 года собирать подписи в поддержку врача начали и местные жители.
Об этом они отчитываются на странице «ВКонтакте». На ней сообщается, что на заседании суда 15 марта 2018 года Андрей Попов рассказал, что в его адрес действительно поступали денежные средства от поставщиков. Но, по его словам, деньги частично шли на то, чтобы закрывать нужды родильного дома из-за недостатка финансирования.
«Были аварийные ситуации, которые нужно было решать в данный момент времени очень срочно. Я подходил к Андрею Васильевичу и объяснял ситуацию, для решения этих ситуаций я получал деньги. Приобретал запчасти, материалы, потом отчитывался по чекам перед Андреем Васильевичем», – приводятся в сообществе слова свидетеля.