Убыток «Петербургских аптек» от продаж составил за год почти 66 млн рублей (1,5% выручки), при этом величина убытка снизилась на 180,7 млн рублей (на 73,3%), а рост выручки опережал рост расходов; рентабельность продаж выросла на 6,5%.
Однако у сети по-прежнему серьезные финансовые проблемы: собственный капитал у предприятия практически отсутствует, а стоимость чистых активов сократилась на 1,5 млн рублей вследствие увеличения суммы налогов при переходе с ЕНВД на общую систему налогообложения и фиксированных отпускных цен на ЖНВЛС.
Кроме того, руководство сети ожидало резкого увеличения товарооборота за счет снижения наценки до уровня 8–10%, однако такого роста, который покрыл бы убытки от снижения цены, не произошло. Просроченная задолженность составила 162,6 млн рублей, из которых 80,5 млн рублей приходится на долг перед дистрибьюторской компанией ЗАО «Империя-Фарма» – эту сумму в течение многих месяцев сеть пыталась оспорить в арбитраже. Дебиторская задолженность «Петербургских аптек» за год выросла на 60% (на 62,8 млн рублей).
В 2013 году сеть намерена выйти на средний уровень наценки 22% с учетом 500 индикаторных позиций, отличающихся низким уровнем цен и ценообразованием на остальные позиции с учетом среднерыночного ценового предложения, а также развития «ассортиментной группы товаров импульсного спроса», в том числе за счет собственных торговых марок, БАД и косметики, включая элитную.