Авторы соответствующего проекта распоряжения считают, что только в таком случае удастся своевременно завершить строительство и ввести новое здание в эксплуатацию.
В соответствии с постановлением Правительства Российской Федерации от 30 декабря 2011 года №1220 «Об осуществлении бюджетных инвестиций в проектирование, строительство и техническое оснащение здания ФГБУ «Научно-исследовательский институт пульмонологии» ФМБА в 2012 году начато строительство нового здания НИИ стоимостью 4,8 млрд рублей. В эксплуатацию здание планировалось ввести в 2016 году. Однако в 2012-2013 годах было принято решение о корректировке проектной документации. На строительство НИИ пульмонологии только на 2014 год в федеральном бюджете было предусмотрено 2,6 млрд рублей.
Из-за отсутствия положительного заключения государственной экспертизы в 2014 году в полном объеме реализовать бюджет не удалось. ФМБА направило в Минфин предложение перераспределить бюджетные ассигнования на сумму 1,74 млрд рублей Фонду содействия реформированию ЖКХ при условии возврата средств в полном объеме в 2015 году. Однако в соответствии с распоряжением Правительства Российской Федерации от 8 ноября 2014 года №2240-р бюджетные ассигнования в размере 1,74 млрд рублей были перераспределены в антикризисный фонд без восстановления в 2015 году. Как говорится в пояснительной записке к проекту распоряжения, строительство зданий НИИ пульмонологии все еще продолжает вестись на основании действующего госконтракта со сроком исполнения в 2015 году. Однако уменьшение стоимости инвестиционного проекта на 1,74 млрд рублей не позволит осуществить оснащение НИИ пульмонологии медицинским оборудованием и выполнить необходимые дополнительные работы. В результате ввести объект в эксплуатацию в 2016 году стало невозможно.
Другая структура ФМБА – ФГБУ РМНПЦ «Росплазма» – уже несколько лет судится с немецкой компанией-подрядчиком Glatt Ingenieurtechnik GmbH из-за недостроенного завода по переработке крови в Кирове, заказ на который поступил от ФМБА. В 2009 году строительство завода было заморожено, а против Glatt Ingenieurtechnik GmbH было возбуждено уголовное дело из-за пропажи 6 млрд рублей.
