В 2012 году, после разделения Минздравсоцразвития на два отдельных ведомства, у министра здравоохранения сохранились пять заместителей. В мае 2013 года Правительство РФ своим постановлением учредило в ряду замминистров шестую позицию, которая оставалась вакантной до марта 2018 года, пока на эту должность не был назначен Олег Салагай, до этого исполнявший функции пресс-секретаря Скворцовой.

В августе 2018 года Медведев расширил число заместителей министра до семи человек, и в течение полугода добавившаяся должность оставалась вакантной. В январе 2019 года седьмым заместителем Скворцовой стала директор Департамента цифрового развития и информационных технологий Минздрава РФ Елена Бойко, которая займется созданием «цифрового контура» в здравоохранении.

На сегодняшний день Веронике Скворцовой помогают семь чиновников – первый заместитель министра Татьяна Яковлева, статс-секретарь Дмитрий Костенников, заместители Евгений Камкин, Сергей Краевой, Наталья Хорова, Олег Салагай и Елена Бойко.