Уголовное дело по ч. 6 ст. 290 УК РФ в отношении Баранкина следователи возбудили в январе 2025 года по материалам УФСБ России по Красноярскому краю. В СК считают, что в 2017 году фигурант обратился к своему знакомому, директору неназванной компании, и предложил передать ему взятки за «содействие в организации систематического заключения контрактов» и побед в конкурсах на поставку медизделий. Правоохранители полагают, что с 2017 по 2022 год ФСНКЦ и компания таким образом заключили 85 контрактов.
По версии следователей, Баранкину удалось получить порядка 16,5 млн рублей, которыми он позднее якобы распорядился по своему усмотрению. На следующий день после задержания, 15 января, правоохранители сообщили о попытке Баранкина совершить суицид в изоляторе временного содержания. После госпитализации фигурант находился в коме. Из-за состояния здоровья суд не смог избрать ему меру пресечения. Но в начале февраля Центральный районный суд Красноярска удовлетворил ходатайство следствия и заключил Бориса Баранкина под стражу, после этого срок ареста неоднократно продлевали. Это дело еще расследуется.
Другое уголовное дело о растрате в особо крупном размере по ч. 4 ст. 160 УК РФ было возбуждено в начале 2023 года. В марте 2024 года расследование было завершено, а материалы позднее передали в суд. По версии стороны обвинения, фигуранты в 2019–2021 годах «организовали схему фиктивных поставок» лекарств в медцентр. «Бюджетные средства в сумме свыше 15 млн рублей перечислялись коммерческой фирме за поставки лекарств, которые закупались и передавались в учреждение. Однако список поставленных лекарственных средств не соответствовал фактической закупке. Медпрепараты приобретались, исходя из личных потребностей организатора схемы и его супруги, и использовались ими для лечебных и косметологических целей», – утверждают в прокуратуре.
В начале сентября 2025 года по делу о растрате гособвинитель запросил для Баранкина 7 лет колонии общего режима и штраф в размере 800 тысяч рублей. Фигурантом дела также выступил представитель поставщика препаратов, для которого прокурор запросил 4 года лишения свободы условно. Как сообщает RTVI, речь идет о Елене Давыдовой из ООО «СибФармЛогистик». По версии следствия, с ней Баранкин организовал схему фиктивных поставок препаратов. В публикации RTVI также говорится, что 15 сентября Давыдова частично признала вину и, как отметил прокурор, частично возместила ущерб, что является смягчающим обстоятельством. Как сообщил прокурор, в отношении Баранкина также нашли смягчающие обстоятельства: наличие наград, состояние здоровья и частичное возмещение ущерба в размере 16 тысяч рублей. Пока Центральный райсуд Красноярска не вынес приговор. Ранее предполагалось, что его огласят 16 сентября.