В пояснительной записке к проекту постановления говорится, что ЕГИСЗ дополняется функционалом по сбору и представлению сведений об организации оказания специализированной и высокотехнологичной медпомощи федеральными медцентрами в соответствии с едиными требованиями базовой программы ОМС. Новшество связно с тем, что с 2021 года для федеральных клиник появился особый порядок и отдельное финансирование работы в этом сегменте.
В числе функций ЕГИСЗ появилось ведение «вертикально интегрированных медицинских информационных систем по отдельным профилям оказания медицинской помощи, заболеваниям, состояниям». На стадии запуска в настоящее время находится такая ВИМИС по профилю «онкология».
Также, согласно пояснительной записке, в функционал ЕГИСЗ должно входить ведение подсистем по обращению препаратов и по поддержке функционирования ситуационного центра. Последняя подсистема предназначена для «повышения качества взаимодействия информационных систем, входящих в инфраструктуру, обеспечивающую информационно-технологическое взаимодействие единой системы и информационных систем в сфере здравоохранения, а также для обеспечения управления качеством обслуживания поставщиков и пользователей инфраструктуры информационного взаимодействия, непрерывностью и доступностью услуг и сервисов, формирования отчетности о ее работе, управления информационной безопасностью и управления инцидентами в работе инфраструктуры единой системы».
Независимая антикоррупционная экспертиза проекта постановления продлится до 17 мая 2021 года, общественное обсуждение – до 25 мая.
В декабре 2013 года единственными исполнителями работ по созданию были назначены ГК «Ростех», ПАО «Ростелеком» и НИИ «Восход». В июле 2019 года дочерняя компания «Ростелекома» «РТ Лабс» и входящий в состав «Ростеха» Национальный центр информатизации создали совместное предприятие (СП) «Цифровые медицинские системы» для разработки медицинских решений и поддержки программного обеспечения для нужд ЕГИСЗ. Инвестиции в проект не раскрывались, а доли в СП распределились почти поровну – 51% получил «РТ Лабс», 49% – ООО «Национальный центр информатизации».
В апреле 2021 года стало известно, что компания «Национальная медицинская экосистема здравоохранения» (АО «НМЭЗ», принадлежит АО «Фармстандарт» Виктора Харитонина) намерена приобрести долю в 49% в ООО «Цифровые медицинские системы».
В декабре 2019 года «Ростех» продлил монопольный статус единственного поставщика до 31 декабря 2020 года, а «Ростелеком» и «Восход» потеряли статус по направлению ЕГИСЗ, при этом госкорпорация «Ростех» получила право привлекать субподрядчиков для исполнения контрактов при единственном условии – личном выполнении не менее 1% от всего госзаказа по ЕГИСЗ.
Общая стоимость строительства ЕГИСЗ превысила 41 млрд рублей. В декабре 2020 года в Минфине РФ сообщили, что бюджет федпроекта «Создание единого цифрового контура в здравоохранении на основе ЕГИСЗ» к 1 декабря был исполнен на 57,5% (26,72 млрд рублей из 46,481 млрд).