Расходы по программе «Столичное здравоохранение» по сравнению с 2019 годом за пять месяцев 2020 года выросли в более чем 2 раза и составили 56% от прогнозируемой суммы на год. При этом расходы по ОМС  за этот период также возросли на 17,6 млрд рублей и составили 91,7 млрд рублей.

За май, когда, по данным Департамента здравоохранения Москвы, в городе случился пик заболеваемости COVID-19 в Москве, было израсходовано 36,2 млрд рублей за счет «Столичного здравоохранения».

По данным столичного Департамента финансов, налоговые поступления в Москве за пять месяцев 2020 года сократились в сравнении с 2019 годом на 7,1% (70 млрд рублей) и составили 919,9 млрд рублей.

Ранее снижение суммы страховых взносов, поступивших налогов и, соответственно, уменьшение доходов Федерального фонда ОМС (ФФОМС) из-за пандемии прогнозировали в Институте социальной политики НИУ ВШЭ. Для покрытия части расходов, направленных на борьбу с COVID-19, территориальные фонды ОМС использовали средства, выделенные на отмененную плановую диспансеризацию, а также в ряде субъектов был увеличен подушевой норматив финансирования медорганизаций, оказывающих первичную медико-санитарную помощь в амбулаторных условиях.

Средний тариф на лечение COVID-19 в России председатель ФФОМС Елена Чернякова оценивала в 100–200 тысяч рублей в зависимости от тяжести заболевания. В Москве средний тариф составляет 200 тысяч рублей. По данным на 15 июня в Москве зафиксировано 207,2 тысячи заболевших коронавирусной инфекцией, из них 123,2 тысячи человек вылечились. Точно рассчитать расходы по ОМС на лечение этих пациентов невозможно, так как нет данных в разрезе тяжести случаев COVID-19, по усредненному тарифу этот показатель может достигать 41 млрд рублей.