Субвенции получат все 85 регионов и город Байконур. Максимальный объем средств будет направлен в Москву – 154,5 млрд рублей, Московскую область –  72,8 млрд рублей, Санкт-Петербург – 51,6 млрд рублей. В лидерах по размеру получаемых субвенций также Краснодарский край (44,5 млрд рублей) и Свердловская область (41,6 млрд рублей).

Аутсайдерами перечня в 2016 году стали Ненецкий автономный округ, который получит 1 млрд рублей, Чукотский автономный округ (1,28 млрд рублей) и Еврейская автономная область (2,17 млрд рублей). Незначительный по сравнению с другими регионами объем средств также будет направлен в Калмыкию – 2,48 млрд рублей и республику Алтай  –  3,19 млрд рублей. Байконур получит 455,6 млн рублей.

Общий объем доходов ФФОМС в 2016 году планируется в сумме 1,66 трлн рублей, расходы составят 1,68 трлн рублей.